2016年2月より、LINEアカウントの引き継ぎ方法が変更となっています。

スマホの機種変更を検討している方へ、LINEの引き継ぎ設定は済んでいますか？

機種変更などでスマートフォンが新しくなる場合、それまで使っていたLINEを変更後のスマートフォンでも使うためには、変更後のスマートフォンにLINEアカウントを引き継ぐ必要があります。

機種変更をした後、LINEアカウントの引き継ぎをせずに「新規登録」をしてしまうと、元々使用していたLINEアカウントが削除され、友だちやグループ、購入したスタンプなど保有していた全ての情報が消えてしまいますので、機種変更を予定されている方は、“機種変更をする前”に必ず、手順にそって引き継ぎを行ってください。

くわしくは下記のページをご参照下さい。
http://official-blog.line.me/ja/archives/53494977.html